Die Uniklinik Köln belegt in der aktuellen Klinikliste des Magazins FOCUS Gesundheit Platz 18 unter den 100 besten Krankenhäusern Deutschlands und Rang 1 in Köln. Darüber hinaus ehrt das Magazin im Rahmen des großen Krankenhausvergleichs die Uniklinik Köln in den folgenden zehn Bereichen mit dem Titel „Top Nationales Krankenhaus 2016“: 

• Geburt
• Darmkrebs
• Brustkrebs
• Depression
• Zwangsstörungen
• Strahlentherapie
• Herzchirurgie
• Kardiologie
• Parkinson
• Alzheimer

Für die umfangreiche deutschlandweite Liste befragte das Magazin mehr als 15.000 Haus- und Fachärzte sowie Chefärzte von Kliniken, welche Häuser sie für die besten halten. Auch Daten zu Fallzahlen, Behandlungsergebnissen, Komplikationsraten, große Umfragen zusammen mit medizinischen Fachgesellschaften und wissenschaftliche Publikationen flossen in die unabhängige Bewertung mit ein. as